農林水産省の機関で、国内の農作物などを外国から侵入しようとする病害虫から守るため、
植物の検疫を行っており、主に穀物船で輸入される小麦、菜種、とうもろこし等の穀類及び
コンテナで輸入される冷凍野菜、玉ねぎなどの検査が行われている。
　四日市港には、名古屋植物防疫所四日市出張所が置かれている。